RPIC Prešov spolupracuje s inštitúciami podporujúcimi malé a stredné podnikanie a rozvoj regiónu na Slovensku a v zahraničí. Je aktívnym partnerom siete Enterprise Europe Network zriadenej Európskou komisiou - Generálnym riaditeľstvom pre podnikanie a priemysel pôsobiacej v takmer 40 krajinách, členom Národnej asociácie pre rozvoj podnikania (NARP) a Slovenskej asociácie podnikateľských a technologických inkubátorov (SAPTI).